Đơn vị trực thuộc Trung tâm Nghiên cứu Ong Trung tâm Nghiên cứu và Phát triển chăn nuôi miền Trung Trung tâm nghiên cứu Bò và Đồng cỏ Ba Vì Trung tâm Thực nghiệm và Bảo tồn vật nuôi Phân Viện Chăn nuôi Nam Bộ Trung tâm nghiên cứu và phát triển chăn nuôi miền Núi Trung tâm nghiên cứu Dê và Thỏ Sơn Tây Trung tâm nghiên cứu gia cầm Thụy Phương Trung tâm Nghiên cứu vịt Đại Xuyên Trung tâm nghiên cứu lợn Thụy Phương Trung tâm nghiên cứu và huấn luyện chăn nuôi